技术专题 | 从细胞构建到药物筛选:HiBiT细胞模型如何加速蛋白降解药物研发?
2026-07-30

近年来,靶向蛋白降解(Targeted Protein Degradation,TPD)已成为创新药研发最活跃的领域之一。从PROTAC、Molecular Glue(分子胶)到LYTAC、AUTAC等新技术不断涌现,蛋白降解正逐步改变传统“小分子抑制剂”的研发模式。然而,在蛋白降解药物研发过程中,一个关键问题始终存在:如何快速、准确、定量地评价目标蛋白是否真正发生了降解?
传统Western Blot虽然能够检测蛋白表达变化,但实验周期长、通量低、定量能力有限,已难以满足高通量药物筛选需求。HiBiT标签技术的出现,为蛋白降解药物发现提供了一种高灵敏、高通量、可实时定量的新型检测平台。目前,HiBiT已广泛应用于PROTAC、分子胶等蛋白降解剂的筛选和药效评价,并逐渐成为国际药企和科研机构开展TPD研究的重要工具。
一、HiBiT:小标签,大作用
HiBiT是NanoLuc® Luciferase系统中的一种超小型发光标签,仅由11个氨基酸组成。当HiBiT与互补蛋白LgBiT结合后,可快速形成完整的NanoLuc荧光素酶,在加入底物后产生高强度生物发光信号。
其最大的特点包括:
1)标签极小(11 aa),对蛋白结构和功能影响较小;
2)灵敏度高,检测动态范围可达数个数量级;
3)无需抗体,减少实验步骤和批间差异;
4)支持活细胞检测,可实时监测蛋白动态变化;
5)适用于96、384甚至1536孔板高通量筛选。
由于发光信号与目标蛋白表达量呈正相关,因此HiBiT能够直接用于蛋白丰度的实时定量检测。
二、HiBiT细胞模型的两种主流构建策略
根据不同的研发需求,HiBiT细胞模型通常可分为原位(Knock-in)和过表达(Harbor-HiBiT)两种构建方式。
方案一:内源HiBiT Knock-in(原位敲入)
该方案采用CRISPR/Cas9介导同源重组(HDR),将HiBiT标签精准插入目标基因的内源位点(N端、C端或特定结构域),实现目标蛋白的内源标记。

技术特点:
1)保持目标蛋白天然启动子调控;
2)保留内源表达水平和时空表达模式;
3)避免过表达带来的实验偏差;
4)更真实地反映蛋白降解效果;
5)特别适用于药效评价和机制研究。
对于PROTAC和分子胶研发而言,内源HiBiT模型已成为评价DC50(降解半数浓度)、Dmax(最大降解率)以及降解动力学的重要工具。
方案二:Harbor-HiBiT稳定表达细胞
另一种策略是在AAVS1等安全位点(Safe Harbor)定点整合HiBiT融合表达载体,实现目标蛋白的稳定表达。

技术特点:
1) 表达稳定,批间一致性高;
2)构建周期相对较短;
3) 适用于难以进行内源编辑的靶点;
4)可灵活设计融合蛋白、突变体或功能片段;
5)易于建立标准化筛选模型。
典型应用:
1) 突变体蛋白降解研究;
2)结构域功能分析;
3) PROTAC先导化合物初筛;
4) 双报告系统构建;
5)大规模药物筛选平台。
对于早期Hit发现和SAR(Structure–Activity Relationship)优化阶段,Harbor模型具有良好的通量优势。
三、HiBiT如何赋能蛋白降解药物研发?
HiBiT技术几乎贯穿蛋白降解药物研发的整个流程。
1. 靶点验证
首先,通过构建HiBiT标记细胞,确认目标蛋白的表达及定位,为后续药物筛选提供可靠模型。
例:研究人源利用CRISPR将HiBiT敲入HEK293T内源性BRD4/BRD2/BRD3位点,用dBET1/dBET6 PROTAC验证内源靶蛋白剂量依赖性降解,首次确立HiBiT用于TPD靶点验证的可行性[1]。

2. 高通量药物筛选(HTS)
HiBiT最大的优势之一,是能够直接用于高通量筛选。实验流程通常包括:
1. 建立HiBiT细胞模型;
2. 加入候选PROTAC或分子胶化合物;
3. 培养一定时间;
4. 加入LgBiT和发光底物;
5. 自动读取发光信号;
6. 计算目标蛋白降解比例。
整个流程无需Western Blot、ELISA或复杂抗体孵育,大幅提升筛选效率。
例:研究人员在MCF7细胞中CRISPR敲入HiBiT-CARM1[1],建立384/1536孔HTS平台,对NCI天然产物库(1408个组分)进行初筛,鉴定出kusunokinin和exostemin两种特异性CARM1降解剂,并经WB和细胞功能实验验证。

3. Lead优化
对于筛选得到的候选化合物,可进一步利用HiBiT检测:
DC50:实现50%蛋白降解所需浓度;
Dmax:目标蛋白最大降解比例;
Dose–Response曲线:评价不同化合物活性差异。
这些指标是PROTAC和分子胶优化过程中最重要的药效参数。
例:研究人员利用HeLa HDAC6-HiBiT LgBiT稳转株对系列HDAC6 PROTAC进行裂解法定量与活细胞动力学检测,系统比较不同linker长度/弹头结构的DC50、Dmax及降解速率,发现某DFMO衍生PROTAC在5 μM出现典型钩状效应,据此淘汰并保留B423等优选结构。

4. 降解动力学研究
HiBiT支持活细胞实时检测,可连续监测:
1)降解起始时间;
2) 最大降解时间;
3) 蛋白恢复速度;
4) 降解持续时间;
5)半衰期(t½)。
相比终点检测,更有助于研究药物作用机制和优化给药方案。
例:研究人员联用HiBiT-NanoBiT与NanoBRET,在同一活细胞中分别实时监测WDR5-PROTAC诱导的靶蛋白降解动力学与三元复合物(Ternary Complex)形成/解离动力学,阐明三元复合物稳定性与降解速率的因果关系[4]。

5. 药效评价
在候选化合物进入体内实验之前,HiBiT模型还可用于:
1)PK/PD相关研究;
2)多时间点药效分析;
3)不同细胞模型验证;
4)联合蛋白质组学分析脱靶效应。
四、HiBiT与传统蛋白检测技术对比

HiBiT不仅提高了检测灵敏度,更重要的是实现了蛋白降解的快速、自动化和标准化检测。
五、粒曼生物HiBiT细胞定制服务
针对蛋白降解药物研发需求,粒曼生物可提供完整的HiBiT细胞模型定制服务,包括:
1、内源HiBiT Knock-in
- CRISPR/Cas9精准编辑
- N端/C端标签设计
- 单克隆筛选
- PCR、Sanger测序验证
- 发光功能验证
- WB验证(可选)
2.现货HEK293-Harbor HiBiT稳定表达细胞
- Safe Harbor定点整合(AAVS1等)
- 融合蛋白表达载体设计
- 单克隆筛选
- 表达稳定性验证
- 发光检测
- 长期冻存与质控
3.配套服务
- HiBiT Harbor基础细胞平台
- PROTAC筛选细胞模型构建
- NanoLuc/HiBiT双报告系统开发
- 高通量药物筛选支持
- CRISPR原位标签(HiBiT、NanoLuc、TurboID、ALFA等)定制开发
六、结语
随着蛋白降解药物研发进入快速发展阶段,对高质量细胞模型和高通量检测平台的需求持续增长。
HiBiT技术凭借超小标签、内源定量、高灵敏发光和自动化检测等优势,已成为连接CRISPR基因编辑、细胞模型构建与蛋白降解药物筛选的重要桥梁。
无论是内源HiBiT Knock-in模型,还是Harbor稳定表达平台,都能够帮助研究人员更加真实、快速、精准地评价候选降解剂的活性,加速从靶点验证到先导化合物优化,再到药效评价的整个研发流程。
未来,随着PROTAC、分子胶等新型降解技术的不断成熟,HiBiT细胞模型将在创新药研发中发挥更加重要的作用,成为蛋白降解药物发现不可或缺的核心工具。
参考文献
[1] Schwinn M K , Machleidt T , Zimmerman K ,et al.CRISPR-Mediated Tagging of Endogenous Proteins with a Luminescent Peptide[J].ACS chemical biology, 2017:467.
[2]Bacabac M, et al. Utilizing the HiBiT System to Identify CARM1 Degraders for Targeted Cancer Therapy. J Med Chem. 2026 Jan 8;69(1):134-145.
[3]Hanl M, Feller F, et al. Target engagement studies and kinetic live-cell degradation assays enable the systematic characterization of HDAC6 PROTACs.bioRxiv.2025.
[4]Schwalm MP, Krämer A, Dölle A, et al. Tracking the PROTAC degradation pathway in living cells highlights the importance of ternary complex measurement for PROTAC optimization. Structure.2023;31(7):747-758.e6.
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