一叶知秋 | HEK293T细胞培养及基因编辑

2026-06-30

1.细胞背景

HEK293T 细胞为人胚胎肾来源,由 HEK293 细胞稳定整合 SV40 大 T 抗原基因改造获得,母株 HEK293 于 1970 年代由荷兰科学家通过腺病毒 DNA 转化人胚肾细胞建立,是生命科学与生物制药领域最常用的工具细胞系之一,被 CCLE、DepMap、Cellosaurus 等权威数据库广泛收录。

HEK293T 细胞为人上皮样肾上皮细胞,贴壁生长,具备极高的转染效率与外源蛋白表达能力;核心分子特征为稳定表达 SV40 大 T 抗原,可使携带 SV40 复制起点的质粒高效扩增,同时保留腺病毒 E1A 基因表达,细胞增殖快、遗传背景清晰、易于培养与基因操作。

HEK293T 细胞主要用于外源基因瞬时表达与重组蛋白制备;慢病毒、逆转录病毒、腺病毒等病毒载体的包装与滴度测定;基因编辑、信号通路、蛋白互作等分子机制研究;以及疫苗研发、病毒学研究与高通量药物筛选等场景。

2.细胞描述

物种:人

组织:肾,胚胎肾细胞

细胞形态:上皮样,贴壁生长,呈单层,细胞形态较为均一,边界清晰,汇合度较高时可形成致密的铺路石样排列。

细胞倍增时间:~24-30h

培养条件

完全培养基成分:DMEM+10% FBS+1% P/S

培养环境:37℃、5%CO₂

传代比例:1:3~1:4

传代频次:2~3天传代一次(细胞汇合度达80%~90%时传代)

消化条件

HEK293T 细胞贴壁性较弱,传代时需采用胰酶消化,消化时间需严格把控(过度消化易造成细胞活力降低、大量脱落、细胞碎片增多;消化不足则细胞不易脱离,易残留细胞团块)。传代时,吸除旧培养基,以预热的 PBS 轻柔洗涤细胞 1-2 次,加入适量 0.25% 胰酶 - EDTA 消化液,37℃孵育 1-2 分钟(若细胞汇合度较高,可适当延长至 2-3 分钟),显微镜下观察到细胞皱缩变圆、细胞间隙增大时,迅速加入含血清的完全培养基终止消化。使用移液管轻柔吹打细胞层,使细胞完全脱壁形成单细胞悬液,收集悬液后 1000 rpm 离心 5 分钟,弃上清,以新鲜完全培养基重悬细胞沉淀并接种至新培养器皿中。吹打过程应动作轻柔,避免剧烈机械损伤导致细胞破碎,同时尽量减少气泡产生。

细胞形态照片

图1 HEK293T细胞正常形态图

细胞特点

HEK293T 细胞的形态学特征与人胚肾转化上皮细胞的形态学特征高度一致。在显微镜下观察,HEK293T 细胞呈现出典型的上皮样多角形或不规则圆形,直径约为 15‑30μm,胞质中等量、透亮且均匀,部分细胞可见细小颗粒状结构,细胞核呈圆形或椭圆形、核质比较高,核仁清晰,偶见双核或多核现象。

在细胞生长的初始阶段,细胞以分散贴壁形式生长,伸展速度快、细胞边界清晰,折光性良好。随着培养时间增加,细胞迅速增殖并汇合成致密单层,呈均匀铺展的铺路石样或网状排列,高汇合度时可保持紧密单层生长,较少出现明显堆叠,这与其高增殖活性及转化细胞的生物学特性相关。

长期传代可能导致细胞形态趋于均一化、增殖速度波动及微小表型改变,建议使用低代次(<20 代)细胞进行实验,以保证外源蛋白表达、病毒包装及基因操作等实验结果的稳定性与可靠性。

3. 常见问题

Q1:HEK293T 细胞贴壁较松、过早脱落,该如何处理

A:HEK293T 细胞为转化型人胚肾细胞,贴壁能力较弱,极易在消化或换液时提前脱落,造成细胞损失与活力下降,可通过以下方式预防和处理:

(1)优化消化前处理:操作动作轻柔,吸除旧培养基时避免枪头直接触碰细胞层,用预热至 37℃的 PBS 缓慢冲洗 1 次即可,减少机械性脱壁。

(2)规范消化操作:使用 0.25% Trypsin-EDTA,以刚好覆盖细胞层为宜,37℃培养箱孵育 1–2 分钟,每隔 30 秒镜下观察,待 50%–60% 细胞皱缩变圆、间隙增大时立即终止消化,严禁超时消化。

(3)防脱落处理:培养前可使用多聚赖氨酸或纤连蛋白包被培养器皿,增强细胞贴附能力;换液时保留少量旧培养基,降低细胞突然脱离风险。

Q2:HEK293T 传代后成团严重、难以吹散,该如何处理

A:HEK293T 细胞增殖速度快、黏附性强,传代后易聚集成团,导致转染效率降低、生长不均,影响蛋白表达、病毒包装等实验结果,可通过以下方式预防和处理:

(1)把控消化终点:消化至细胞刚出现收缩、即将脱壁时立即终止,消化不足易粘连成团,消化过度易聚团死亡;终止液体积建议为胰酶的 2 倍,快速中和酶活。

(2)优化吹打方式:用 1mL 移液管轻柔、均匀吹打瓶底 5–8 次,避免剧烈吹打产生气泡或造成细胞破碎,吹打后静置片刻使大团块自然沉降。

(3)严重成团处理:离心重悬后使用 40μm 细胞筛过滤去除大团块;控制传代比例 1:4–1:8,接种密度过高会显著加重聚集。

Q3:HEK293T 细胞状态变差、增殖变慢、转染效率降低,该如何处理

A:HEK293T 长期高代次培养易出现表型漂移、形态变圆、增殖减慢及转染能力下降,导致外源蛋白表达与病毒包装效率大幅降低,数据不可靠,可通过以下方式预防和处理:

(1)严控细胞代次:建议使用低代次(<20 代)细胞开展实验,早期大量冻存种子细胞,定期复苏更新。

(2)规范培养节奏:细胞汇合度达到 70%–80% 立即传代,严禁过度长满、堆叠老化;使用稳定批次的 DMEM+10% FBS 体系,减少血清更换。

(3)环境与操作优化:保持培养箱 37℃、5% CO₂稳定;尽量缩短胰酶暴露时间;转染前确保细胞状态良好、密度适宜;若状态持续恶化,直接弃用,复苏新批次低代细胞。

 

4.HEK293T细胞TRIM21基因敲除示例

CRISPR基因敲除基于非同源重组修复(NHEJ),是指细胞内的相关蛋白直接将断裂的DNA两端重新连起来,随机引入或缺失一定数量的碱基。这种修复方式的基础是细胞染色体的复制,我们发现倍增时间越短的细胞编辑起来越简单而且效率也更高,比如HEK293T细胞系(倍增时间12-16h),其ko pool敲除效率大部分能达到80%以上。而HEK293T细胞在进行TRIM21基因敲除时,因TRIM21基因部分序列存在保守结构域,易与家族同源基因产生序列同源性干扰,导致sgRNA脱靶风险升高,同时该细胞贴壁松散、转染后易脱落,部分细胞对高浓度转染试剂存在毒性敏感,导致TRIM21基因编辑效率波动较大。针对这种情况,优化了sgRNA设计方案(结合TRIM21基因特异性序列特点,避开同源保守区域,设计特异性高、切割效率强且脱靶风险低的sgRNA),并通过大量实验优化了细胞转染条件(调整转染试剂与核酸的比例、转染孵育时间,结合HEK293T细胞状态选择汇合度50%-60%时进行转染,降低试剂毒性),同时优化转染后培养及吹打流程,避免细胞脱落损伤,保证细胞活性与分散度,最终在HEK293T细胞的TRIM21基因ko pool敲除效率也能达到90%以上,单克隆筛选阳性率稳定。

HEK293T细胞TRIM21基因敲除示例:

靶点基因

细胞系

KO效率

DNA测序结果

对蛋白质影响

TRIM21

HEK293T

100%

与野生型序列相比在早期外显子发生片段丢失或移码突变

造成蛋白N端提前终止翻译

基因型如下: